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一站式RNA电泳套装图片
产品货号:
BTN60904
中文名称:
一站式RNA电泳套装
英文名称:
One-Stop RNA Electrophoresis Pack
产品规格:
10次
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
本品是包括琼脂糖、去离子甲醛、RNA上样液、电泳液等在内的RNA电泳套装,专门用于RNA电泳分析。可以进行至少10次mini变性胶电泳。

产品特点:
1.即开即用,用户不需要自己进行RNase灭活、高压灭菌、pH调节等操作。
2.与Northern杂交等后续反应兼容。

产品组成:
成分规格
琼脂糖5g
超纯水250mL
甲醛60mL
RNAload(含EB)0.5mL
RNAep,10×100mL
说明书1份


储存条件:常温运输和保存,但收到货后RNAload需要4℃保存,RNAep,10×一旦打开需要-20℃保存,有效期一年。

使用方法:
注意:所有器皿(三角瓶,电泳槽,枪头等)均需去除RNase。强烈推荐使用本公司的超强无毒的固相RNase清除剂。

一、配制琼脂糖甲醛变性胶(1.2%,100mL)
1.在三角瓶中加入下列成份:琼脂糖1.2~1.5g;DEPC水87mL
2.将琼脂糖加热融化后,加入10mL 10×RNAep(10×RNAep就是10×MOPS缓冲液,其瓶子一旦打开,就很容易产生污染细菌,细菌大量繁殖后会释放大量RNase,所以剩下的10×RNAep最好-20℃放置)。
3.待胶冷却至60℃左右,再加下列成份:甲醛3.0mL;自备EB(10mg/mL)2~4μL
注意:由于本试剂盒提供的RNAload中含EB,所以也可以不加EB,但效果较差。如果使用自备的其他染料,如SYBR Green I,则不能同时使用其他染料,包括含EB的RNAload,用户需要另购不含EB的RNAload)。
4.混匀后倒胶,凝固半小时后即可以使用。

二、配制电泳液
5.将RNAep用DEPC水稀释十倍后即成电泳液,所需要的体积根据使用的电泳槽决定。

三、变性RNA样品
6.在一干净的离心管中将5~10μL RNA和15μL RNAload混合,50~60℃保温10分钟后冰浴5~10分钟,直接上样。注意:每一泳道至多可分析30μg RNA,通常用10~20μg总RNA进行Northern杂交,可以检测高丰度mRNA(占mRNA总量的0.1%以上);如待测RNA含量极微,每个泳道需加0.5~3.0μg poly(A)+ RNA。

四、电泳
7.电泳时,将凝胶预电泳5min(电压为5 V/cm)。随后加样品和分子量对照(如果有的话),以3-4 V/cm的电压电泳,直至染料迁移至胶下游的3/4处。
8.电泳结束后,在300nm紫外灯下拍照。

五、后续处理
9.按标准方法进行Northern杂交等后续处理。

使用效果:
一站式RNA电泳套装
图注:用本产品电泳兔全血总RNA效果图。10μL总RNA与15μL RNAload混合后在甲醛琼脂糖变性胶上电泳0.5小时,直接在紫外灯下观察并照相。

疑难解答:
Q:RNA电泳为何最好使用RNAep,不要使用DNA电泳液TAE或TBE?
A:一是因为RNAep经过去RNase处理,而一般实验室使用的TAE或TBE都没有经过去RNase处理,故极有可能含RNase,使样品RNA降解。即使要灭活TAE或TBE中的RNase也十分麻烦,因为DEPC不能处理含Tirs的缓冲液;二是TEB含有硼酸,硼酸是研究多羟基醇和糖的经典试剂,它能与RNA中含多羟基的核糖反应生成糖硼酸络合物,故电泳时RNA带型十分弥散。在一定浓度范围内,RNA分子间还能通过硼酸形成分子间复合物,出现电泳时各种RNA以一条带的形式出现的现象。所以RNA电泳时要避免使用含硼酸的缓冲液。使用TAE效果虽然比TBE稍好,但文献报道(BioTechniques 2000,28:414-415),它不能分离某些大小不同的RNA分子。
Q:上样孔里的红色荧光物一定是污染的基因组DNA吗?
A:不是。用TAE或TBE电泳液和非变性胶电泳RNA时容易产生此现象,初步研究发现大部分红色荧光物是变性不充分的单链RNA通过碱基互补或通过硼酸络合(如果使用TBE作电泳液的话)形成的复合物,加RNase处理后,这些红色荧光物一般会消失。为避免此现象,建议最好使用甲醛变性胶电泳。如果需要使用非变性胶,也必须在上样前使RNA变性。
使用百奥莱博优化的上样/变性/染色三用溶液RNAload可以使RNA在非变性胶上电泳时也有较好分辨率。使用非变性胶时,可以使用TAE或超快电泳液SuperBuffer-2,最好不要使用TBE缓冲液,因为TBE中的硼酸能与RNA的多羟基形成复合物,RNA很难形成锐利的条带。
Q:如何确认和去处除污染的基因组DNA?
A:如果怀疑有DNA污染,可以用RNase处理RNA样品,然后再电泳。如果上样孔里的红色荧光物不消失,则表示是基因组DNA污染。进一步确认可以使用PCR扩增法。去除污染的DNA可以使用非酶的DNA去除剂DNAScavenger或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有残留的RNase污染,所以必须严格按照厂家提供的使用手册进行操作。
Q:为何我的植物RNA样品有4~5条带?
A:部分植物组织有叶绿体等质体,而叶绿体有核糖体,所以也有其rRNA。
叶绿体的rRNA跟细胞浆里面核糖体的rRNA大小不同,所以一般会多出两条带(共4条rRNA条带)。小的tRNA和5S rRNA有时可见,有时不可见,取决于回收效率。
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